Contando sempre com o vocalista e letrista Chorão na linha de frente, dando o direcionamento artístico e executivo, o Charlie Brown Jr passou por muitas transformações ao longo dos anos e segue em frente escrevendo alguns dos capítulos mais surpreendentes dentro da história do rock brasileiro, integrando uma geração que contou ainda com Raimundos, Planet Hemp e O Rappa.
Em 1999, o Charlie Brown Jr formado por Chorão, Thiago Castanho, Marcão, Champignon e pelo baterista Pelado lança seu segundo álbum: “Preço Curto... Prazo Longo...”. E com esta mesma formação lança em 2000 o disco “Nadando com os Tubarões”. Em 2001 é lançado “100% Charlie Brown Jr (Abalando a sua Fábrica), sem o guitarrista Thiago Castanho que foi trabalhar em outros projetos musicais. Com a formação de quarteto (vocal, guitarra, baixo e bateria) o Charlie Brown Jr lança “Bocas Ordinárias” em 2002, “Acústico MTV” em 2003 e “Tâmo ai na Atividade” (premiado com o Grammy Latino) em 2004.